Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Slc5a7Q8BGY9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms