Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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