Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd4Q8BFT6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Jmjd4Q8BFT6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms