Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms