Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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