Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc29Q80VM3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms