Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ckap2lQ7TS74 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms