Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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