Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrc2bQ7TPM1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms