Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Eci3Q78JN3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms