Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc88cQ6VGS5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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