Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
NipblQ6KCD5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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