Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fbxo27Q6DIA9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms