Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms