Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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