Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Sema3cQ62181 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sema3cQ62181 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms