Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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