Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rbbp4Q60972 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms