Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tsr1Q5SWD9 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tsr1Q5SWD9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tsr1Q5SWD9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Tsr1Q5SWD9 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tsr1Q5SWD9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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