Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tns3Q5SSZ5 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms