Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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