Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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