Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm5460Q3UQ97 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm5460Q3UQ97 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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