Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms