Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms