Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms