Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms