Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx27Q3UHD6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms