Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnrc6cQ3UHC0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms