Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm5113Q3UGK8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5113Q3UGK8 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms