Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U1D9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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