Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX3

Smyd5, SET and MYND domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd5Q3TYX3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smyd5Q3TYX3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms