Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms