Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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