Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fam178bQ24JP3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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