Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ptcd3Q14C51 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptcd3Q14C51 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms