Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms