Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps8Q0P5W1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms