Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gdf3Q07104 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms