Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Siah2Q06986 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms