Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox12Q04890 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms