Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cxcr5Q04683 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms