Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms