Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GscQ02591 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms