Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gja5Q01231 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gja5Q01231 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms