Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms