Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms