Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Itga4Q00651 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms