Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pax8Q00288 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms