Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Mid1-205ENSMUST00000112105 3974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cited1P97769 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms